Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NR2F1P10589 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms