Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD63P08962 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD63P08962 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD63P08962 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD63P08962 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms