Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPBP07199 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPBP07199 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPBP07199 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPBP07199 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms