Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C6orf47O95873 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms