Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4FO95754 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms