Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CNOT4O95628 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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