Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCN2BO60939 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms