Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CREB3O43889 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB3O43889 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms