Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EMC8O43402 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EMC8O43402 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EMC8O43402 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EMC8O43402 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms