Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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