Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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