Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP290O15078 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEP290O15078 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CEP290O15078 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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CEP290O15078 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP290O15078 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP290O15078 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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