Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRTO14522 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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