Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC4-APOC2K7ER74 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms