Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PCH4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PCH4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PCH4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PCH4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PCH4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms