Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PATL2C9JE40 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PATL2C9JE40 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms