Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CFAP73A6NFT4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CFAP73A6NFT4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms