Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TARSL2A2RTX5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms