Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNPO3Q9Y5L0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms