Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHMP3Q9Y3E7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHMP3Q9Y3E7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms