Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDM2AQ9Y2K7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms