Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHANK2Q9UPX8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms