Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms