Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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