Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GALPQ9UBC7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms