Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ABI3Q9P2A4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ABI3Q9P2A4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms