Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCHIP1Q9P0W5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms