Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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