Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNAJC28Q9NX36 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNAJC28Q9NX36 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms