Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN6Q9NWW5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms