Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms