Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOMER3Q9NSC5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms