Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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FANCFQ9NPI8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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FANCFQ9NPI8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FANCFQ9NPI8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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FANCFQ9NPI8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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FANCFQ9NPI8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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FANCFQ9NPI8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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