Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms