Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms