Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms