Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR2J2Q9GZM3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms