Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMBRA1Q9C0C7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms