Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXQ1Q9C009 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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FOXQ1Q9C009 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1Q9C009 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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