Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF17Q9BXT8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF17Q9BXT8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms