Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA5Q9BWX5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA5Q9BWX5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms