Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM79Q9BSE2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM79Q9BSE2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms