Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms