Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP9Q99956 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms