Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX2Q99697 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms