Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms