Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPS6KC1Q96S38 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPS6KC1Q96S38 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms