Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LINC00208Q96KT6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms