Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms