Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGGTAQ92696 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGGTAQ92696 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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